Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms