Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RNFT2Q96EX2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms