Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CMTM5Q96DZ9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms