Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER1Q8TDN7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER1Q8TDN7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACER1Q8TDN7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms