Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF397Q8NF99 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF397Q8NF99 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms