Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG8Q8ND04 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG8Q8ND04 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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