Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HJURPQ8NCD3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms