Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM87AQ8NBN3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM87AQ8NBN3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms