Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NME8Q8N427 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME8Q8N427 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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