Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SVBPQ8N300 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVBPQ8N300 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms