Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC149Q6ZUS6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC149Q6ZUS6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms