Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZRN4Q6ZMN7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms