Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C12orf54Q6X4T0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms