Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN11Q5T124 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN11Q5T124 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN11Q5T124 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN11Q5T124 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN11Q5T124 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBXN11Q5T124 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms