Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM74A1Q5RGS3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM74A1Q5RGS3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms