Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC178Q5BJE1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms