Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ESCO2Q56NI9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms