Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGAP29Q52LW3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGAP29Q52LW3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms