Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL40Q2TBA0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL40Q2TBA0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms