Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM71Q2Q1W2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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