Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNCBQ16143 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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