Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUM3Q15397 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms