Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDK1Q15118 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDK1Q15118 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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