Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCLAFQ15004 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCLAFQ15004 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCLAFQ15004 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PCLAFQ15004 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCLAFQ15004 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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