Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BECN1Q14457 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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