Protein–RNA interactions for Protein: Q13617

CUL2, Cullin-2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL2Q13617 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CUL2Q13617 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CUL2Q13617 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms