Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRR1Q13601 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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