Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAF1Q13077 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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TRAF1Q13077 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAF1Q13077 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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