Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRDNQ13061 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRDNQ13061 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
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