Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ECH1Q13011 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ECH1Q13011 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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