Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPRL3Q12980 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPRL3Q12980 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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