Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
FOXF2Q12947 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FOXF2Q12947 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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FOXF2Q12947 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXF2Q12947 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXF2Q12947 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXF2Q12947 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXF2Q12947 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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