Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM3Q08188 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms