Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR3Q06889 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR3Q06889 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms