Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTDSPL2Q05D32 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTDSPL2Q05D32 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms