Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNB3Q05901 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNB3Q05901 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms