Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD164Q04900 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CD164Q04900 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms