Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TLE4Q04727 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TLE4Q04727 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms