Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms