Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN7AQ01118 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms