Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSG6Q00889 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms