Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPM4P67936 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPM4P67936 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM4P67936 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM4P67936 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TPM4P67936 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM4P67936 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms