Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RPS28P62857 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RPS28P62857 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS28P62857 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RPS28P62857 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms