Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NAP1L1P55209 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAP1L1P55209 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms