Protein–RNA interactions for Protein: P53063

RAI1, Decapping nuclease RAI1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAI1P53063 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.57□□□□□ -2.16
RAI1P53063 GEA2YEL022W 4380 nt1.57□□□□□ -2.16
RAI1P53063 SEC3YER008C 4011 nt1.56□□□□□ -2.16
RAI1P53063 snR61snR61 90 nt1.56□□□□□ -2.16
RAI1P53063 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.55□□□□□ -2.16
RAI1P53063 NUP188YML103C 4968 nt1.55□□□□□ -2.16
RAI1P53063 STF2YGR008C 255 nt1.54□□□□□ -2.16
RAI1P53063 YLR232WYLR232W 348 nt1.54□□□□□ -2.16
RAI1P53063 NUP145YGL092W 3954 nt1.54□□□□□ -2.16
RAI1P53063 YHR217CYHR217C 462 nt1.53□□□□□ -2.16
RAI1P53063 CFT1YDR301W 4074 nt1.53□□□□□ -2.17
RAI1P53063 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.52□□□□□ -2.17
RAI1P53063 CDC25YLR310C 4770 nt1.51□□□□□ -2.17
RAI1P53063 ROM2YLR371W 4071 nt1.51□□□□□ -2.17
RAI1P53063 AZF1YOR113W 2745 nt1.51□□□□□ -2.17
RAI1P53063 CHS1YNL192W 3396 nt1.5□□□□□ -2.17
RAI1P53063 EST2YLR318W 2655 nt1.5□□□□□ -2.17
RAI1P53063 MEC1YBR136W 7107 nt1.49□□□□□ -2.17
RAI1P53063 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
RAI1P53063 IRA1YBR140C 9279 nt1.49□□□□□ -2.17
RAI1P53063 PET127YOR017W 2403 nt1.48□□□□□ -2.17
RAI1P53063 COG6YNL041C 2520 nt1.47□□□□□ -2.17
RAI1P53063 BRR2YER172C 6492 nt1.47□□□□□ -2.17
RAI1P53063 CDC39YCR093W 6327 nt1.47□□□□□ -2.17
RAI1P53063 RAD9YDR217C 3930 nt1.46□□□□□ -2.18
RAI1P53063 SSK2YNR031C 4740 nt1.45□□□□□ -2.18
RAI1P53063 SPC110YDR356W 2835 nt1.45□□□□□ -2.18
RAI1P53063 YDR210WYDR210W 228 nt1.45□□□□□ -2.18
RAI1P53063 SBH1YER087C-B 249 nt1.45□□□□□ -2.18
RAI1P53063 SEC8YPR055W 3198 nt1.44□□□□□ -2.18
RAI1P53063 FYV8YGR196C 2454 nt1.44□□□□□ -2.18
RAI1P53063 PIK1YNL267W 3201 nt1.44□□□□□ -2.18
RAI1P53063 SXM1YDR395W 2835 nt1.43□□□□□ -2.18
RAI1P53063 KAP120YPL125W 3099 nt1.43□□□□□ -2.18
RAI1P53063 CCH1YGR217W 6120 nt1.43□□□□□ -2.18
RAI1P53063 RCO1YMR075W 2055 nt1.43□□□□□ -2.18
RAI1P53063 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.42□□□□□ -2.18
RAI1P53063 RPM2YML091C 3609 nt1.41□□□□□ -2.18
RAI1P53063 MSN5YDR335W 3675 nt1.41□□□□□ -2.18
RAI1P53063 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt1.41□□□□□ -2.18
RAI1P53063 PRP16YKR086W 3216 nt1.39□□□□□ -2.19
RAI1P53063 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.39□□□□□ -2.19
RAI1P53063 CLU1YMR012W 3834 nt1.39□□□□□ -2.19
RAI1P53063 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.38□□□□□ -2.19
RAI1P53063 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.38□□□□□ -2.19
RAI1P53063 SEC1YDR164C 2175 nt1.38□□□□□ -2.19
RAI1P53063 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt1.37□□□□□ -2.19
RAI1P53063 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.37□□□□□ -2.19
RAI1P53063 BIR1YJR089W 2865 nt1.36□□□□□ -2.19
RAI1P53063 HKR1YDR420W 5409 nt1.36□□□□□ -2.19
RAI1P53063 YDL073WYDL073W 2955 nt1.35□□□□□ -2.19
RAI1P53063 BEM3YPL115C 3387 nt1.33□□□□□ -2.2
RAI1P53063 YNL266WYNL266W 420 nt1.31□□□□□ -2.2
RAI1P53063 YSP1YHR155W 3687 nt1.3□□□□□ -2.2
RAI1P53063 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt1.28□□□□□ -2.2
RAI1P53063 UBP3YER151C 2739 nt1.25□□□□□ -2.21
RAI1P53063 snR81snR81 201 nt1.24□□□□□ -2.21
RAI1P53063 ULP2YIL031W 3105 nt1.24□□□□□ -2.21
RAI1P53063 GLG1YKR058W 1851 nt1.23□□□□□ -2.21
RAI1P53063 NNF2YGR089W 2811 nt1.23□□□□□ -2.21
RAI1P53063 LAA1YJL207C 6045 nt1.22□□□□□ -2.21
RAI1P53063 MSH3YCR092C 3057 nt1.21□□□□□ -2.21
RAI1P53063 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.21□□□□□ -2.22
RAI1P53063 SPT7YBR081C 3999 nt1.21□□□□□ -2.22
RAI1P53063 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.21□□□□□ -2.22
RAI1P53063 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.21□□□□□ -2.22
RAI1P53063 YGR130CYGR130C 2451 nt1.19□□□□□ -2.22
RAI1P53063 CAT8YMR280C 4302 nt1.18□□□□□ -2.22
RAI1P53063 SEC10YLR166C 2616 nt1.15□□□□□ -2.23
RAI1P53063 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.14□□□□□ -2.23
RAI1P53063 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.13□□□□□ -2.23
RAI1P53063 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.12□□□□□ -2.23
RAI1P53063 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt1.11□□□□□ -2.23
RAI1P53063 NST1YNL091W 3723 nt1.11□□□□□ -2.23
RAI1P53063 NUP192YJL039C 5052 nt1.11□□□□□ -2.23
RAI1P53063 BUD3YCL014W 4911 nt1.1□□□□□ -2.23
RAI1P53063 RKR1YMR247C 4689 nt1.09□□□□□ -2.23
RAI1P53063 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.09□□□□□ -2.24
RAI1P53063 YJR029WYJR029W 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
RAI1P53063 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
RAI1P53063 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.08□□□□□ -2.24
RAI1P53063 ANS1YHR126C 480 nt1.07□□□□□ -2.24
RAI1P53063 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt1.07□□□□□ -2.24
RAI1P53063 BEM2YER155C 6504 nt1.06□□□□□ -2.24
RAI1P53063 RPS26AYGL189C 360 nt1.05□□□□□ -2.24
RAI1P53063 VAM6YDL077C 3150 nt1.04□□□□□ -2.24
RAI1P53063 EST1YLR233C 2100 nt1.04□□□□□ -2.24
RAI1P53063 CSE1YGL238W 2883 nt1.04□□□□□ -2.24
RAI1P53063 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.04□□□□□ -2.24
RAI1P53063 HUG1YML058W-A 207 nt1.04□□□□□ -2.24
RAI1P53063 snR45snR45 172 nt1.04□□□□□ -2.24
RAI1P53063 SCC2YDR180W 4482 nt1.03□□□□□ -2.24
RAI1P53063 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.03□□□□□ -2.24
RAI1P53063 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.03□□□□□ -2.24
RAI1P53063 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.03□□□□□ -2.24
RAI1P53063 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.03□□□□□ -2.24
RAI1P53063 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.03□□□□□ -2.24
RAI1P53063 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.03□□□□□ -2.24
RAI1P53063 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.03□□□□□ -2.24
RAI1P53063 YPR117WYPR117W 7470 nt1.03□□□□□ -2.25
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