Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTDSS1P48651 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTDSS1P48651 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms