Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRCC3P46736 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRCC3P46736 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRCC3P46736 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRCC3P46736 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRCC3P46736 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms