Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GGCXP38435 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GGCXP38435 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GGCXP38435 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GGCXP38435 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GGCXP38435 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GGCXP38435 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms