Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2IP36954 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2IP36954 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms