Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL9P32969 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL9P32969 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL9P32969 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL9P32969 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL9P32969 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL9P32969 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL9P32969 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL9P32969 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL9P32969 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL9P32969 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL9P32969 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL9P32969 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL9P32969 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL9P32969 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL9P32969 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL9P32969 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL9P32969 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL9P32969 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL9P32969 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPL9P32969 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL9P32969 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL9P32969 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL9P32969 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms